性自認（せいじにん）とは、人間が有している自己の性別に関する確信である。英語の Gender Identity に相当する言葉であり、性自認の他に性の自己認知 性同一性などの訳語がある。人間は、自分の性が何であるかを認識している。多くの場合は確信している。その確信のことを性自認と呼ぶ。通常は身体的性別と完全に一致しているが、半陰陽のケースなどを研究する中で、この確信は身体の性とは別個に考えるべきであると言うことが判明してきた。そのようなケースに於いては、身体的に男女の中間形態を取ったりあるいは男女両方の特徴を持つ場合がある。では、自分が男性であると考えているのだろうか？ 女性であると考えているのであろうか？彼らの自己の性に関する確信を調べると、それは「男女のうち、より近い方」とも限らず、「染色体の示す性」とも限らず、「どちらでもない」というものであるとも限らず、実に様々な確信を持っていることが分かった。すなわち、身体の性とも染色体型とも別個に「自己の性に関する確信」が存在することが確認され、これは性自認と呼ばれるようになった。性自認に関わる代表的な障害としては性同一性障害がある。これは、身体的には男女のいずれかに属するにも関わらず性自認が身体的性別とは食い違っている事例をいう。
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